Informacija

Denovo 2Gb viso genomo sekos nustatymas mažame sekvencijoje

Denovo 2Gb viso genomo sekos nustatymas mažame sekvencijoje


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Kokie yra mažesnių „Illumina“ sekvenavimo priemonių (pvz., „iSeq100“, „miniSeq“) apribojimai, norint atlikti de novo viso genomo sekos nustatymą organizme, turinčiame didesnį genomą (~ 2 Gb)?

Naiviai atrodo, kad net jei aš galiu atlikti tik 5 MB vertės seką per 24 valandų važiavimą šiais sekiniais, po maždaug dvejų metų nuolatinio veikimo aš turėčiau turėti pakankamai skaitymų, kad galėčiau surinkti de novo didesnio eukarioto genomo seka (pasroviui skirtos bioinformatikos problemos). Tačiau akivaizdu, kad sekvencijos įrenginiai niekada nėra parduodami taip, ir aš sunkiai suprantu, kodėl.

Mane domina GWAS apie nemodelinius stuburinius gyvūnus, jei tai svarbu. Šis laikotarpis neatrodo beprotiškas, nes kai kurie lauko eksperimentai užtrunka keletą metų, kol kažkas bus paskelbta.


Tačiau aišku, kad sekventuotojai niekada nėra parduodami taip, ir aš sunkiai suprantu, kodėl.

Jūs nematote, kodėl dvejų metų prietaiso reagento išlaidos ar vienas projektas gali būti laikomas draudžiamu?