We are searching data for your request:
Upon completion, a link will appear to access the found materials.
Šiuo metu ieškau PAT-seq protokolo, o kai kalbama apie naudojamą brūkšninį kodavimą, dokumentuose minima, kad seka yra „N“ ir „NN“, taip pat „V“. Pavyzdžiui:
… CCGATCTNNxxxTTT… TTTVN
kur „…“ yra sekos santrumpa, o „xxx“ yra brūkšninio kodo sekos vieta.
Kaip matote, prieš brūkšninių kodų seką yra „NN“, o T sekos pabaigoje yra „VN“. Jame teigiama, kad „NN“ patvirtina, kad gauti rodmenys gaunami iš skirtingų RT reakcijų, o ne visi iš vieno RT produkto, kuris buvo pernelyg sustiprintas.
Taigi aš spėju, kad „N“ reiškia tik nenustatytą nukleotidą. Ar tai teisinga? Bet kaip tada su „V“?
Standartinė IUPAC nomenklatūra leidžia rašyti pagrindus, kurie nėra vienareikšmiškai apibrėžti.
Pavyzdžiui, „N“ reiškia „bet kokia bazė“, o „V“ reiškia „A, C arba G, bet ne T“.
Visą sąrašą žiūrėkite čia