Informacija

Žiema_2021_Bis2A_Facciotti_Reading_21 – Biologija

Žiema_2021_Bis2A_Facciotti_Reading_21 – Biologija


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Mokymosi tikslai, susiję su 2020_SS1_Bis2a_Facciotti_Reading_21

  • Apibūdinkite pagrindinius pagrindinės dogmos komponentus ir ryšius tarp jų, įskaitant replikacijos, transkripcijos, vertimo, atvirkštinės transkripcijos procesus ir galimus įvairių galimų produktų (ty mRNR, tRNR, rRNR, fermentų, struktūrinių baltymų, replikuotų chromosomų) likimus. ir tt).
  • Kurkite iliustracijas, modeliuojančias RNR struktūras. Tai turėtų apimti kelis detalumo ir abstrakcijos lygius, įskaitant animacinių filmų modelius:
    • a. trys nukleotidai ir jų fosfodiesteriniai ryšiai.
    • b. sumažintas mRNR ir tRNR vaizdas.

  • Atsižvelgdami į abstrahuotą genominės srities modelį, teisingai interpretuokite genų, promotorių ir kitų funkcinių elementų vaizdus, ​​kurie vaizduojami kaip geometriniai objektai, nubrėžti ant linijinės genomo koordinatės, kaip abstrakčiai DNR sekų atvaizdai.
  • Naudokite transkripcijos vieneto modelį, kad aptartumėte kiekvieno transkripcijos vieneto struktūrinio elemento vaidmenį. Nurodykite tuos, kurie yra transkribuojami, kurie gali būti išversti ir kurie atlieka kitus vaidmenis.
  • Sukurkite dinaminį modelį (žodinį, piešinį ir pan.). procesas transkripcijos, apimančios reagentus, produktus, fermentus, DNR vietas, reikalingas transkripcijai, ir kaip šie komponentai sąveikauja su DNR šablonu skirtingu proceso metu.
  • Apibūdinkite, kaip eukariotų genų nuorašai apdorojami prieš vertimą ir to svarbą kuriant funkcinę įvairovę.

Genetinės informacijos srautas

Bakterijose, archėjose ir eukariotuose pagrindinis DNR vaidmuo yra saugoti paveldimą informaciją, koduojančią instrukcijų rinkinį, reikalingą atitinkamam organizmui sukurti. Nors mes daug geriau išmokome greitai perskaityti cheminę sudėtį (nukleotidų seką genome ir kai kurias chemines modifikacijas, kurios

yra pagaminti

mes vis dar nežinome, kaip patikimai iššifruoti visą informaciją ir visus mechanizmus, kuriais ji naudojama.

yra skaitomas

ir galiausiai išreikštas.

Tačiau yra keletas pagrindinių principų ir mechanizmų, susijusių su genetinio kodo skaitymu ir išraiška, kurių pagrindiniai žingsniai

yra suprantami

ir tai turi būti visų biologų konceptualių priemonių rinkinio dalis. Du iš šių procesų yra transkripcija ir vertimas, kurie yra DNR įrašyto genetinio kodo dalių įvedimas į susijusios polimerinės RNR molekules ir RNR kodo nuskaitymas ir kodavimas į baltymus.

BIS2A mes sutelkiame dėmesį į supratimą apie

procesas

transkripcijos (prisiminkime, kad Energy Story yra proceso aprašymo rubrika) ir jos vaidmenį genetinės informacijos išraiškoje. Mes motyvuojame savo diskusiją apie transkripciją sutelkdami dėmesį į funkcines problemas (pateikdami mūsų problemų sprendimo / projektavimo iššūkių rubrikos dalis), kurios turi būti

būti išspręstas

procesas, kuris turi vykti. Tada aprašome, kaip vyksta procesas

yra naudojamas

Gamta sukuria įvairias funkcines RNR molekules (kurios gali turėti įvairių struktūrinių, katalizinių ar reguliavimo funkcijų), įskaitant vadinamąją pasiuntinio RNR (

mRNR

) molekules, kurios neša informaciją, reikalingą baltymams sintetinti. Taip pat mes sutelkiame dėmesį į iššūkius ir klausimus, susijusius su vertimo procesu, procesu, kurio metu ribosomos sintetina baltymus.

Mes dažnai vaizduojame pagrindinį genetinės informacijos srautą biologinėse sistemose schemoje, vadinamoje „centrine dogma“ (žr. paveikslėlį žemiau). Ši schema teigia, kad DNR užkoduota informacija transkripcijos būdu patenka į RNR ir galiausiai paverčiama baltymais. Tokie procesai kaip atvirkštinė transkripcija (DNR kūrimas iš ir RNR šablono) ir replikacija taip pat yra informacijos sklidimo įvairiomis formomis mechanizmai. Tačiau ši schema per se nieko nesako apie tai, kaip informacijayra užkoduotasarba apie mechanizmus, kuriais reguliavimo signalai juda tarp įvairių modelyje pavaizduotų molekulių tipų sluoksnių. Todėl, nors žemiau pateikta schema yra beveik būtina bet kurio biologo leksikos dalis, galbūt likusi išsenasBe to, mokiniai turėtų žinoti, kad informacijos srauto mechanizmai yra sudėtingesni (apie kai kuriuos sužinosime eidami, o „centrinė dogma“ reiškia tik kai kuriuos pagrindinius kelius).

figūra 1. Genetinės informacijos srautas.
Priskyrimas:Markas T. Facciotti (originalus darbas)

Genotipas į fenotipą

Svarbi sąvoka tolesniuose skyriuose yra ryšys tarp genetinės informacijos, genotipas, o jo išreiškimo rezultatas fenotipas. Šios dvi sąlygos ir mechanizmai, kurie juos sieja, busbūti aptartipakartotinai per ateinančias kelias savaites – pradėkite naudotis šiuo žodynu.

2 pav. Informacija DNR, kuri busbūti išreikštastranskripcijos būduyra saugomasatskirų nukleotidų sekoje, nuskaitomoje 5'–3' kryptimi. Informacijos pavertimas iš DNR į RNR (procesas, vadinamas transkripcija) išreiškia šią informaciją į laikiną kopiją, kuri gali veikti tokia, kokia yra (pvz.,tRNR,rRNR) arba pranešimą, kuriame koduoja informaciją, reikalingą baltymui sukurti (pvz.,mRNR). Ląstelės naudojamRNRkaip šablonas baltymų kūrimui per vertimą. Čia parodome dvi skirtingas DNR sekas. Dėl kiekvienos DNR sekos skirtumų susidaro dvi skirtingosmRNR, po kurio seka dviejų skirtingų baltymų sintezė. Galiausiai šie skirtingi baltymai sukuria dvi skirtingas pelių kailio spalvas.

Genotipas reiškia informaciją, saugomą organizmo DNR, nukleotidų seką ir jo genų kompiliaciją. Fenotipas reiškia bet kokias fizines savybes, kurias galite išmatuoti, pvz., ūgį, svorį, pagaminto ATP kiekį, gebėjimą metabolizuoti laktozę ir atsaką į aplinkos dirgiklius. Genotipo skirtumai, netnežymus, gali sukelti skirtingus fenotipus, kuriems taikoma natūrali atranka. Aukščiau pateiktame paveikslėlyje pavaizduota ši idėja. Taip pat atkreipkite dėmesį į tai, kad klasikiniu požiūriu kalbame apie genotipo ir fenotipo ryšįkontekstądaugialąsčius organizmus, ši nomenklatūra ir pagrindinės sąvokos galioja visiems organizmams, net ir vienaląsčiams organizmams, tokiems kaip bakterijos ir archėjos.

Genai

Kas yra genas? A genas yra DNR segmentas organizmo genome, koduojantis funkcinę RNR (pvz

rRNR

,

tRNR

,

ir tt

.)

arba

baltymų produktas (fermentai, tubulinas ir kt.). Bendrajame gene yra elementų, koduojančių reguliavimo sritis, ir regiono, koduojančio transkribuotą vienetą.

Genai gali įgyti mutacijos– apibrėžiamas kaip nukleotidų sudėties ir (arba) sekos pokyčiai – koduojančiose arba reguliavimo srityse. Šios mutacijos gali sukelti keletą pasekmių: (1) dėl to neįvyksta nieko išmatuojamo; (2) genas nebėra išreikštas; arba (3) geno produkto ekspresija arba elgsena

(

s) yra skirtingi. Organizmų populiacijoje, kuri dalijasi tuo pačiu

genas

skirtingi geno variantai

yra žinomi

kaip aleliai. Skirtingi aleliai gali lemti individų fenotipų skirtumus ir prisidėti prie biologijos įvairovės, esant selektyviniam spaudimui.

Pradėkite mokytis šių žodyno terminų ir susijusių sąvokų. Tada būsi

šiek tiek

susipažinę su jais, kai į juos pasinersime per kitas paskaitas.

3 pav. Genassusideda išRNR arba baltymo produkto koduojanti sritis kartu su jos reguliavimo sritimis.Kodavimo sritis yra transkribuojamaįRNRkuriostada išverčiamaį baltymus.

Transkripcija iš DNR į RNR

Skyriaus santrauka

Bakterijos, archėjos ir eukariotai turi transkribuoti genus iš savo genomų. Nors ląstelių vieta gali būti skirtinga (eukariotai atlieka transkripciją branduolyje; bakterijos ir archėjos atlieka transkripciją citoplazmoje), mechanizmai, kuriais kiekvienas iš šių kladų atlieka šį procesą, yra šie:iš esmėstas pats ir galibūti charakterizuojamastrimis etapais: pradžios, pailgėjimo ir užbaigimo.

Trumpastranskripcijos apžvalga

Transkripcija yraprocesassukuriant DNR segmento RNR kopiją. Kadangi tai yra a procesas, norime pritaikyti rubriką Energy Story, kad galėtume geriau suprasti transkripciją. Kaip atrodo molekulių sistema prieš prasidedant transkripcijai? Kaip tai atrodo pabaigoje? Kokios medžiagos transformacijos ir energijos perdavimas vyksta transkripcijos metu ir kas katalizuoja šį procesą? Taip pat norime pagalvoti apie procesą nuo aDizaino iššūkispožiūriu. Jei biologinė užduotis yra sukurti DNR kopiją chemine RNR kalba, kokių iššūkių galime pagrįstai spėti arba tikėtis, atsižvelgiant į mūsų žinias apie kitus nukleotidų polimerų procesus.būti įveiktam? Ar yra įrodymų, kad gamta šias problemas išsprendė įvairiais būdais? Atrodo, kokie yra transkripcijos sėkmės kriterijai? Jūs supratote idėją.

Kai kurie pagrindiniai transkripcijos reikalavimai

Pirmiausia apsvarstykime atliekamas užduotis, pasinaudodami tam tikromis savo pagrindinėmis žiniomis ir įsivaizduodami, kas gali nutikti transkripcijos metu, jei tikslas yra padaryti dvigrandės DNR molekulės vienos grandinės RNR kopiją. Pamatysime, kad naudojant tam tikrą pagrindinę logiką galime padaryti išvadą apie daugelį svarbių klausimų ir dalykų, kuriuos turime žinoti

tvarka

tinkamai aprašyti procesą.

Įsivaizduokime, kad norime suprojektuoti a

nanomašina

/nanobot, kuris atliktų transkripciją. Kai kuriuos galime panaudoti

Dizaino iššūkis

mąstymas, siekiant nustatyti problemas ir subproblemas, kurių reikia

būti išspręstas

mūsų mažasis robotas.

• Kur turėtų paleisti mašina? Iš milijonų iki milijardų bazinių porų, kur turėtų būti mašina

būti nukreiptas

?
• Kur mašina turėtų sustoti?
• Jei turime pradžios ir sustabdymo svetaines, mums reikės būdų, kaip užkoduoti šią informaciją, kad mūsų mašina

(

s) gali perskaityti šią informaciją – kaip tai bus

būti įvykdytas

?
• Kiek mums reikės padaryti DNR RNR kopijų?
• Kaip greitai reikia RNR kopijų

būti padaryta

?
• Kaip tiksliai reikia kopijų

būti padaryta

?
• Kiek energijos pareikalaus procesas ir iš kur ji bus gaunama?

Tai tik keletas pagrindinių klausimų. Jei nori, gali kasti giliau. Tačiau jie jau yra pakankamai geri, kad galėtume gerai pajusti šį procesą. Taip pat atkreipkite dėmesį, kad daugelis šių klausimų yra labai panašūs į tuos, kurių, mūsų manymu, gali prireikti norint suprasti DNR replikaciją.

Transkripcijos statybiniai blokai

RNR statybiniai blokai

Prisiminkite iš mūsų diskusijos apie nukleotidų struktūrą, kad RNR statybiniai blokai yra labai panašūs į esančius DNR. RNR statybinius blokus sudaro nukleotidų trifosfatai, kurieyra sudarytiribozės cukraus, azoto bazės ir trijų fosfatų grupių. Pagrindiniai DNR ir RNR statybinių blokų skirtumai yra tokieRNR molekulės yra sudarytosnukleotidų su ribozės cukrumi (priešingai nei dezoksiribozės cukrumi) ir naudoti uridiną, uracilą, kuriame yra nukleotidų (priešingai nei timidinas DNR). Toliau atkreipkite dėmesį, kad uracilas ir timinas yra struktūriškai labai panašūs – uracile tiesiog trūksta metilo (CH3) funkcinė grupė, palyginti su timinu.

figūra 1. Pagrindiniai cheminiai nukleotidų komponentai.
Priskyrimas:Markas T. Facciotti (originalus darbas)

Transkripcijos inicijavimas

Reklamuotojai

Baltymai, atsakingi už tam tikros DNR dalies RNR kopijos (transkripcijos) sukūrimą, pirmiausia turi sugebėti atpažinti elemento pradžią.būti nukopijuotas. A propaguotojas yra DNR seka, prie kurios prisijungia ir pradeda transkripciją įvairūs baltymai, bendrai vadinami transkripcijos mechanizmais. Daugeliu atvejų promotoriai egzistuoja prieš srovę (5' nuo koduojančios srities) nuo jų reguliuojamų genų. Konkreti promotoriaus seka yra labai svarbi, nes ji lemia, ar ląstelė visą laiką, kartais ar retai transkribuoja atitinkamą koduojančią geno dalį. Nors promotoriai skiriasi įvairiose rūšyse, keli panašių sekų elementaikartais yra konservuoti. Prie-10ir-35regionuose prieš srovę nuo inicijavimo vietos, yra dupropaguotojaskonsensusą sekas arba regionus, panašius daugelyje promotorių ir įvairiose rūšyse. Kai kurie promotoriai turės seką, labai panašią į konsensuso seką (seka, kurioje yra dažniausiai pasitaikantys sekos elementai), o kiti atrodys labai skirtingai. Šie sekos variantai turi įtakos stiprumui, prie kurio transkripcijos mechanizmas gali prisijungti prie promotoriaus, kad pradėtų transkripciją. Tai padeda kontroliuoti nuorašų skaičiųyra pagamintiir kaip dažnai jie gaminami.

2 pav. a) Bendra geno schema. Genas apima promotoriaus seką, netransliuotą sritį (UTR) ir koduojančią seką. (b) Kelių stiprių E. coli sąrašaspropaguotojassekos. Dėžutė -35 ir -10 dėžutėyra labai konservuotisekas visame stiprių promotorių sąraše. Silpnesni promotoriai turės daugiau bazinių porų skirtumų, palyginti su šiomis sekomis.
Šaltinis: http://www.discoveryandinnovation.co...paskaita12.html

Bakteriniai ir eukariotų promotoriai

Bakterijų ląstelėse -10 konsensuso seka, vadinama -10 sritimi, yra turtinga AT, dažnai TATAAT. -35 seka, TTGACA,

yra pripažintas

ir surištas su baltymu σ. Kai ši baltymų ir DNR sąveika

yra pagamintas

, pagrindinės RNR polimerazės subvienetai jungiasi prie vietos. Dėl santykinai mažesnio AT asociacijų stabilumo, AT turtingas -10 regionas palengvina DNR šablono išvyniojimą ir

kelisfosfodiesterissudaromos obligacijos

.

Eukariotų promotoriai yra daug didesni ir sudėtingesni nei prokariotiniai promotoriai, tačiau abu turi AT turtingą sritį – eukariotuose

paprastai vadinamas

TATA dėžutę. Pavyzdžiui, pelės timidino kinazės gene,

yra TATA dėžutė

adresu

maždaug -30

. Šio geno tiksli TATA dėžutės seka yra TATAAAA, kaip nurodyta 5'–3' kryptimi

nešablonas

kryptis. Ši seka nėra identiška E. coli -10 regiono, bet abu dalijasi kokybe

esamas

AT turtingas elementas.

Vietoj vienos bakterinės polimerazės daugumos eukariotų genomai koduoja tris skirtingas RNR polimerazes, kurių kiekviena susideda iš dešimties ar daugiau baltymų subvienetų. Kiekviena eukariotinė polimerazė taip pat reikalauja atskiro baltymų rinkinio, žinomo kaip transkripcijos faktoriai įdarbinti jį reklamuotoju. Be to, daugybė kitų transkripcijos faktorių, baltymų, žinomų kaip stiprikliai, ir duslintuvai, padeda reguliuoti kiekvieno promotoriaus RNR sintezę. Stiprintuvai ir duslintuvai turi įtakos transkripcijos efektyvumui, bet yra

nereikalinga

už transkripcijos ar jos procesijos inicijavimą. Baziniai transkripcijos faktoriai yra labai svarbūs formuojant a išankstinio inicijavimo kompleksas DNR šablone, kuris vėliau įdarbina RNR polimerazę transkripcijos inicijavimui.

Transkripcijos pradžia prasideda nuo RNR polimerazės prisijungimo prie propaguotojas. Transkripcijai reikalinga dviguba DNR spiralėiš dalies atsipalaiduotitokia, kad viena sruoga galibūti naudojamas kaipRNR sintezės šablonas. Atsipalaidavimo regionasvadinamasa transkripcijos burbulas.

3 pav. Pailgėjimo metu RNR polimerazė seka DNR šabloną, sintezuojasimRNR5'-3' kryptimi ir išsivynioja, tada pervynioja DNR kaip jiyra skaitomas.

Pailgėjimas

Transkripcija visada vyksta iš šablono kryptis, viena iš dviejų dvigrandės DNR grandžių. RNR produktas papildo šablono grandinę ir yra beveik identiškasnešablonaskryptis, vadinama kodavimo kryptis, išskyrus tai, kad RNR yra uracilas (U) vietoj timino (T), esančio DNR. Prailginimo metu fermentas vadinamas RNR polimerazė tęsiasi palei DNR šabloną, pridedant nukleotidus bazių poravimu su DNR šablonu panašiai kaip DNR replikacija, o skirtumas yra RNR grandinė, kuriyra susintetintasnelieka susietas su DNR šablonu. Vykstant pailgėjimui, DNRyra nuolat išvyniojamasprieš pagrindinį fermentą ir atsisuka už jo. Atkreipkite dėmesį, kad sintezės kryptis yra tokia pati kaip irsynthesesėDNR – nuo ​​5' iki 3'.

4 pav. Pailgėjimo metu RNR polimerazė seka išilgai DNR šablono ir sintezuojasimRNR5'-3' kryptimi, išvynioti ir tada persukti DNR kaiptai skaitoma.

5 pav. Nukleotidų pridėjimas transkripcijos proceso metu yra labai panašus į nukleotidų pridėjimąinDNR replikacija. RNRyra polimerizuotasnuo 5' iki 3' ir su kiekvienu nukleotido pridėjimu, afosfoanhidridasobligacija yrahidrolizuotasfermentas, todėl polimeras yra ilgesnis ir išsiskiria du neorganiniai fosfatai.
Šaltinis: http://utminers.utep.edu/rweb/html/...ilgesys.html

Bakterinis ir eukariotinis pailgėjimas

Bakterijose pailgėjimas prasideda atsipalaidavus σ subvienetas iš polimerazės. Disociacija σ leidžia pagrindiniam fermentui eiti palei DNR šabloną, sintetinant

mRNR

5'-3' kryptimi maždaug 40 nukleotidų per sekundę greičiu. Vykstant pailgėjimui, DNR

yra nuolat išvyniojamas

prieš pagrindinį fermentą ir atsisuka už jo. Bazių poravimas tarp DNR ir RNR nėra pakankamai stabilus, kad išlaikytų DNR stabilumą

mRNR

sintezės komponentai. Vietoj to, RNR polimerazė veikia kaip stabili jungtis tarp DNR šablono ir besiformuojančių RNR grandinių, kad būtų užtikrintas pailgėjimas.

nėra pertraukiamas

per anksti.

Eukariotuose, susidarius išankstiniam iniciacijos kompleksui, polimerazei

paleistas

nuo kitų transkripcijos faktorių ir

pailgėjimas leidžiamas

sintetina polimerazę, kaip tai daroma prokariotuose

pre-mRNR

5'-3' kryptimi. Kaip aptarta anksčiau, RNR polimerazė II transkribuoja didžiąją dalį eukariotų genų, todėl šiame skyriuje daugiausia dėmesio bus skiriama tam, kaip ši polimerazė atlieka pailgėjimą ir nutraukimą.


Galimas NB Diskusija Taškas

Palyginkite ir palyginkite DNR replikacijos inicijavimo + pailgėjimo energijos istoriją su transkripcijos inicijavimo + pailgėjimo energijos istorija.


Nutraukimas

Bakterijose

Kartą genas

yra transkribuojamas

, bakterinė polimerazė turi atsiskirti nuo DNR šablono ir išlaisvinti naujai pagamintą

mRNR

. Priklausomai nuo transkribuojamo geno, yra dviejų tipų pabaigos signalai. Vienas yra

a

baltymų pagrindu, o kitas – RNR pagrindu. Nuo Rho priklausomas nutraukimas

yra kontroliuojamas

prie

rho

baltymas, kuris seka augantį polimerazę

mRNR

grandine. Netoli geno pabaigos polimerazė susiduria su G nukleotidų eiga DNR šablone ir jis sustoja. Dėl to,

rho

baltymas susiduria su polimeraze. Sąveika su rho atpalaiduoja

mRNR

iš transkripcijos burbulo.

Nuo Rho nepriklausomas nutraukimas

yra kontroliuojamas

pagal specifines sekas DNR šablono grandinėje. Kai polimerazė artėja prie transkribuojamo geno pabaigos, ji susiduria su regionu, kuriame gausu CG nukleotidų. The

mRNR

susilanksto atgal ant savęs ir jungiasi papildomi CG nukleotidai

kartu

. Rezultatas yra stabilus plaukų segtukas dėl to polimerazė sustoja vos tik tai

pradeda transkribuoti

regionas, kuriame gausu AT nukleotidų. Papildomas UA regionas

mRNR

nuorašas sudaro tik silpną sąveiką su šablono DNR. Tai kartu su sustingusia polimeraze sukelia pakankamai nestabilumo, kad pagrindinis fermentas atsiskirtų ir išlaisvintų naują.

mRNR

nuorašas.

Eukariotuose

Skirtingų polimerazių transkripcijos pabaiga skiriasi. Skirtingai nei prokariotuose, eukariotuose vyksta RNR polimerazės II pailgėjimas1,000– 2000 nukleotidų už transkribuojamo geno galo. Šis išankstinismRNRuodegavėliau pašalinamasskilimo metumRNRapdorojimas.Kita vertus, RNRI ir III polimerazėms reikia nutraukimo signalų. RNR polimerazės I transkribuoti genai turi specifinę 18 nukleotidų seką, kuriyra pripažintasužbaigimo baltymu. RNR polimerazės III nutraukimo procesas apima amRNRplaukų segtukas panašusįrho nepriklausomas transkripcijos nutraukimas prokariotuose.

Archėjose

Transkripcijos nutraukimas archėjose yra daug mažiau ištirtas nei kitose dviejose gyvenimo srityse irvis dar nėra gerai suprantamas. Nors funkcinės detalės gali būti panašios į mechanizmus, kurie turimatytaskitose gyvenimo srityse smulkmenos yra anapusapimtisšis kursas.

Korinio ryšio vieta

Bakterijose ir archėjose

Bakterijose ir archėjose transkripcija vykstacitoplazma,kur DNRyra įsikūręs. Kadangi DNR vieta, taigi ir transkripcijos procesas,nėra fiziškai atskirtiiš likusios ląstelės dalies vertimas dažnai prasideda dar nepasibaigus transkripcijai. Tai reiškia, kadmRNRbakterijose irarchaeayra naudojamaskaip baltymo šabloną, kol jis gamina visąmRNR. Erdvinės segregacijos trūkumas taip pat reiškia, kad šie procesai laiko atžvilgiu yra labai mažai atskirti. 6 paveiksle pavaizduoti vienu metu vykstantys transkripcijos ir vertimo procesai.

6 pav. Nukleotidų pridėjimas transkripcijos proceso metu yra labai panašus į nukleotidų pridėjimąinDNR replikacija.
Šaltinis:Markas T. Facciotti (savo darbas)

Eukariotuose....

Eukariotuose transkripcijos procesasyra fiziškai atskirtasiš likusios ląstelės dalies, atskirtos branduolio viduje. Dėl to atsiranda du dalykai:įmRNRyra baigtasprieš pradedant vertimą, ir yra laiko „koreguoti“ arba „redaguoti“.mRNRprieš pradedant vertimą. Fizinis šių procesų atskyrimas suteikia eukariotams galimybę pakeistimRNRtokiu būdu, kad prailgintų jo tarnavimo laikąmRNRar net pakeisti baltyminį produktą, kuris busbūti gaminamasnuomRNR.

MRNRapdorojimas

5 colių G-dangtelis ir 3 colių poli-A uodega

Kadaeukariotasgenasyra transkribuojamas, ląstelė apdoroja pirminį transkriptą branduolyje keliais būdais. Eukariotinės ląstelėsmodifikuotimRNR3' gale pridedant poli-A uodegą. Šis A likučio paleidimaspridedamasfermentu, kuris nenaudoja genominės DNR kaip šablono. ThemRNRturi cheminę 5' galo modifikaciją, vadinamą 5' dangteliu. Duomenys rodo, kad šios modifikacijos padeda pailginti jų tarnavimo laikąmRNR(užkirsti kelią priešlaikiniam jo skilimui citoplazmoje) ir padėtimRNRpradėti vertimą.

7 pav. išankstinismRNRyra apdorojamižingsnių serijoje.Intronaiyra pašalinami, 5 colių dangtelis ir poli-A uodegapridedami.
Šaltinis: http://www.discoveryandinnovation.co...paskaita12.html

Galimas NB Diskusija Taškas

Transkriptomika yra „-omikos“ atšaka, apimanti organizmo ar populiacijos transkripto arba visų RNR molekulių rinkinio tyrimą. Kokios informacijos galite gauti studijuodami transkriptą (-us)? Ar galite sugalvoti kokių šaunių mokslinių klausimų, kuriuos galėtų padėti išspręsti transkriptominė analizė? Kokie yra transkriptominių metodų apribojimai, kuriuos galima turėti omenyje atliekant analizę?


Alternatyvus sujungimas

Sujungimas vyksta daugumoje eukariotųmRNRkuriuose intronaiyra pašalinaminuomRNRseka ir egzonaiyra perrištikartu. Tai gali sukurti daug trumpesnįmRNRnei iš pradžių transkribuota. Sujungimas leidžia ląstelėms maišytis ir suderintikuriosegzonaiyra įtrauktiį finaląmRNRproduktas. Kaip parodyta paveikslėlyje žemiau, dėl to vienas genas gali užkoduoti kelis baltymus.

8 pav. DNR saugoma informacija yra baigtinė.Kai kuriais atvejais, organizmai gali maišyti ir suderinti šią informaciją, kad sukurtų skirtingus galutinius produktus. Eukariotuose alternatyvus sujungimas leidžia sukurti skirtingusmRNRproduktai, kuriesavo ruožtuyra naudojamivertime, kad būtų sukurtos skirtingos baltymų sekos. Tai galiausiai lemia skirtingų baltymų formų gamybą, taigi ir skirtingas baltymų funkcijas.
Šaltinis: http://www.discoveryandinnovation.co...paskaita12.html


Naršyti knygas

Statistikos mokymosi įvade pateikiama prieinama statistinio mokymosi srities apžvalga – esminis įrankių rinkinys, leidžiantis suprasti didžiulius ir sudėtingus duomenų rinkinius, kurie per pastaruosius dvidešimt metų atsirado įvairiose srityse – nuo ​​biologijos iki finansų iki rinkodaros ir astrofizikos. Šioje knygoje pateikiami kai kurie svarbiausi modeliavimo ir prognozavimo metodai bei atitinkamos programos. Temos apima tiesinę regresiją, klasifikavimą, pakartotinio atrankos metodus, susitraukimo metodus, medžiu pagrįstus metodus, paramos vektorines mašinas, klasterizavimą ir kt. Pateiktiems metodams iliustruoti naudojama spalvota grafika ir realūs pavyzdžiai. Kadangi šio vadovėlio tikslas yra padėti mokslo, pramonės ir kitų sričių specialistams naudotis šiais statistinio mokymosi metodais, kiekviename skyriuje yra pamoka, kaip įgyvendinti analizes ir metodus, pateiktus R, itin populiarioje atvirojo kodo statistikos programinės įrangos platformoje. . Du iš autorių kartu parašė statistinio mokymosi elementus (Hastie, Tibshirani ir Friedman, 2-asis leidimas 2009 m.), populiarią statistikos ir mašininio mokymosi tyrinėtojų žinyną. Įvadas į statistinį mokymąsi apima daugelį tų pačių temų, tačiau tokiu lygiu, kuris prieinamas daug platesnei auditorijai. Ši knyga skirta statistikams ir ne statistikams, kurie nori naudoti pažangiausius statistikos mokymosi metodus savo duomenims analizuoti. Tekste daroma prielaida, kad tik ankstesnis tiesinės regresijos kursas ir nėra žinių apie matricinę algebrą.


Prieigos parinktys

Gaukite visą žurnalo prieigą 1 metams

Visos kainos nurodytos NET.
PVM bus pridėtas vėliau kasoje.
Mokesčių apskaičiavimas bus baigtas apmokėjimo metu.

Gaukite ribotą laiką arba visą straipsnių prieigą „ReadCube“.

Visos kainos nurodytos NET.


PADĖKA

Šis darbas buvo paremtas pagrindine Nacionalinio augalų genomo tyrimų instituto ir Mokslo ir technologijų departamento SERB dotacija, skirta AP paleisties tyrimams. MT ačiū Biotechnologijos departamentui, Govt. Indijos, skirtos finansuoti pagalbą Ramalingaswami stipendijos forma (dotacijos Nr. BT/HRD/35/02/2006). PKT pripažįsta Naujojo Delio Biotechnologijos departamentą už finansinę paramą TATA inovacijų stipendijos forma. Autoriai dėkoja DBT-eLibrary konsorciumui (DeLCON) už suteiktą prieigą prie el. išteklių.